戦いの舞台となるステージ。ニンテンドー3DS版とWii U版で、収録ステージが異なります。『for ニンテンドー3DS』は携帯型ゲーム機で発売したソフトを中心に、『for Wii U』ではホームコンソール型ゲーム機で発売したソフトを中心に収録しています。（一部、両方に入っているステージもあります）

ニンテンドー3DSのステージ

＜3Dランド＞
『スーパーマリオ 3D ランド』をモチーフにしたステージ。画面が自動的にスクロールして行き、さまざまなしかけが登場します。

＜コトブキランド＞
『とびだせ どうぶつの森』に登場した「コトブキランド」のステージ。対戦のたびに、島の形状やヤシの木の配置などが変わります。

＜プリズムタワー＞
『ポケットモンスター X・Y』のミアレシティに登場するタワーです。このタワーの周りを浮遊する足場が飛び回り、その上で戦います。

＜汽車＞
『ゼルダの伝説 大地の汽笛』のステージ。線路を走る汽車の上で戦います。走行中に別の貨車に入れ替わったり、ボンバー列車やキラー列車がやってきたりします。運転手はもちろん機関士リンクです。

＜レインボーロード＞
『マリオカート７』のコース「レインボーロード」がモチーフです。浮遊する足場がコース上にランダムで着地します。その時には、ヘイホーカートが走行してくることもあるので、ぶつからないように注意！

Wii Uのステージ

＜パイロットウイングス＞
『パイロットウイングス』と『パイロットウイングス リゾート』のハイブリッドステージ。滑走路やウーフーアイランドを飛び回る飛行機の上で戦います。途中、飛行機が入れ替わるときに落ちてしまわないように注意！

＜村と街＞
『街へいこうよ どうぶつの森』のステージ。足場が村と街を行き来します。時刻によって昼夜などの変化があり、観客も毎回異なります。

＜マリオギャラクシー＞
「マリオギャラクシー」は、ちょっと変わったステージ。星の中央に重力が働いていて、ステージの端では垂直ジャンプも真上に対するふっとびも、斜め方向に打ちあがります。

両方に登場するステージ

＜戦場＞
大きな足場と、空中に浮かぶ3つのすりぬけ床で構成された基本的なステージ。シンプルですが、さまざまな駆け引きが楽しめます。

＜ワイリー基地＞
『ロックマン2　Dr.ワイリーの謎』に登場する「Dr.ワイリー」の基地を背景にしたステージ。時折、基地からやってくる「イエローデビル」が、ファイター達の邪魔をします。

「イエローデビル」は、弱点の目を攻撃すると倒せますが、その時に発生する大爆発に、他のファイターを巻き込むこともできます。

＜特設リング＞
『PUNCH-OUT!!』がモチーフのステージ。リング内だけでなく、場外乱闘もできます。左右のリングロープを使っての大ジャンプや、リングの上にあるライトを攻撃して落下させることもできます。